MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 7227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002679	TGG	3	9	197591	197599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_002679	ACG	2	6	197643	197648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_002679	TCG	2	6	197668	197673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_002679	TGAG	2	8	197744	197751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_002679	TCA	2	6	197775	197780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_002679	GCT	2	6	197811	197816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_002679	CTG	2	6	197854	197859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_002679	GTC	2	6	197867	197872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_002679	CAT	3	9	198250	198258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488245
4010	NC_002679	AGGC	2	8	198335	198342	25 %	0 %	50 %	25 %	13488245
4011	NC_002679	TTC	2	6	198358	198363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488245
4012	NC_002679	TC	3	6	198372	198377	0 %	50 %	0 %	50 %	13488245
4013	NC_002679	GAT	2	6	198447	198452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488245
4014	NC_002679	CGA	2	6	198494	198499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488245
4015	NC_002679	GTG	2	6	198554	198559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488245
4016	NC_002679	GAG	2	6	198619	198624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488245
4017	NC_002679	GC	3	6	198654	198659	0 %	0 %	50 %	50 %	13488245
4018	NC_002679	GAG	2	6	198661	198666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488245
4019	NC_002679	GC	3	6	198710	198715	0 %	0 %	50 %	50 %	13488245
4020	NC_002679	GCG	2	6	198734	198739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488245
4021	NC_002679	TGA	2	6	198747	198752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488245
4022	NC_002679	CG	3	6	198866	198871	0 %	0 %	50 %	50 %	13488245
4023	NC_002679	GCC	2	6	198883	198888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488245
4024	NC_002679	GGGCG	2	10	198974	198983	0 %	0 %	80 %	20 %	13488245
4025	NC_002679	TCG	2	6	199025	199030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488245
4026	NC_002679	ATC	2	6	199159	199164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488245
4027	NC_002679	CG	3	6	199187	199192	0 %	0 %	50 %	50 %	13488245
4028	NC_002679	ATC	2	6	199204	199209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488245
4029	NC_002679	CAA	2	6	199227	199232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488245
4030	NC_002679	TTC	2	6	199330	199335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488245
4031	NC_002679	GTC	2	6	199411	199416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488245
4032	NC_002679	TCC	2	6	199421	199426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488245
4033	NC_002679	GCG	2	6	199526	199531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_002679	CGA	2	6	199583	199588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_002679	ACC	2	6	199645	199650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_002679	AGCC	2	8	199711	199718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_002679	AT	3	6	199785	199790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_002679	TTTTC	2	10	199796	199805	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4039	NC_002679	TGA	2	6	199966	199971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488123
4040	NC_002679	GC	3	6	200004	200009	0 %	0 %	50 %	50 %	13488123
4041	NC_002679	TTA	2	6	200034	200039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488123
4042	NC_002679	TGG	2	6	200118	200123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488123
4043	NC_002679	TTC	2	6	200215	200220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488123
4044	NC_002679	CAG	2	6	200326	200331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488123
4045	NC_002679	TCG	2	6	200343	200348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488123
4046	NC_002679	TTG	2	6	200360	200365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488123
4047	NC_002679	AAT	2	6	200426	200431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488123
4048	NC_002679	TGC	2	6	200657	200662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488123
4049	NC_002679	GCT	2	6	200664	200669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488123
4050	NC_002679	GCC	2	6	200687	200692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488123
4051	NC_002679	TAGA	2	8	200762	200769	50 %	25 %	25 %	0 %	13488123
4052	NC_002679	CG	3	6	200773	200778	0 %	0 %	50 %	50 %	13488123
4053	NC_002679	CAA	2	6	200828	200833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488123
4054	NC_002679	AGA	2	6	200852	200857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488123
4055	NC_002679	CGAT	2	8	200889	200896	25 %	25 %	25 %	25 %	13488123
4056	NC_002679	TGT	2	6	200978	200983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488123
4057	NC_002679	GACT	2	8	201054	201061	25 %	25 %	25 %	25 %	13488123
4058	NC_002679	CAG	3	9	201082	201090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488123
4059	NC_002679	GCCA	2	8	201098	201105	25 %	0 %	25 %	50 %	13488123
4060	NC_002679	ATA	2	6	201117	201122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488123
4061	NC_002679	ATC	2	6	201230	201235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_002679	TGT	2	6	201369	201374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488246
4063	NC_002679	CCT	2	6	201450	201455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488246
4064	NC_002679	CCA	2	6	201480	201485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488246
4065	NC_002679	GC	3	6	201523	201528	0 %	0 %	50 %	50 %	13488246
4066	NC_002679	ACA	2	6	201564	201569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488246
4067	NC_002679	TCGA	2	8	201601	201608	25 %	25 %	25 %	25 %	13488246
4068	NC_002679	CTG	3	9	201640	201648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488246
4069	NC_002679	GCC	2	6	201766	201771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488246
4070	NC_002679	AGG	2	6	201780	201785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488246
4071	NC_002679	GC	3	6	201816	201821	0 %	0 %	50 %	50 %	13488246
4072	NC_002679	AGCGC	2	10	201822	201831	20 %	0 %	40 %	40 %	13488246
4073	NC_002679	CGT	2	6	201834	201839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488246
4074	NC_002679	GTC	2	6	201925	201930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488246
4075	NC_002679	TAG	2	6	201932	201937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488246
4076	NC_002679	CGT	2	6	201944	201949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488246
4077	NC_002679	CGA	2	6	201976	201981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488246
4078	NC_002679	A	6	6	202155	202160	100 %	0 %	0 %	0 %	13488246
4079	NC_002679	GAT	2	6	202195	202200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488246
4080	NC_002679	AGC	2	6	202270	202275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488246
4081	NC_002679	TGGA	2	8	202308	202315	25 %	25 %	50 %	0 %	13488246
4082	NC_002679	CAG	2	6	202393	202398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488246
4083	NC_002679	CCG	2	6	202646	202651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488246
4084	NC_002679	CGAAG	2	10	202713	202722	40 %	0 %	40 %	20 %	13488246
4085	NC_002679	GCA	2	6	202727	202732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488246
4086	NC_002679	CGG	2	6	202878	202883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_002679	CG	3	6	202947	202952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_002679	AGT	2	6	203007	203012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_002679	TTC	2	6	203067	203072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488247
4090	NC_002679	GCCC	2	8	203077	203084	0 %	0 %	25 %	75 %	13488247
4091	NC_002679	CG	3	6	203122	203127	0 %	0 %	50 %	50 %	13488247
4092	NC_002679	GAC	2	6	203143	203148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488247
4093	NC_002679	CCG	2	6	203169	203174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488247
4094	NC_002679	CCTC	2	8	203220	203227	0 %	25 %	0 %	75 %	13488247
4095	NC_002679	TGC	2	6	203339	203344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488247
4096	NC_002679	GCA	2	6	203380	203385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488247
4097	NC_002679	AAC	2	6	203401	203406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488247
4098	NC_002679	AGT	2	6	203638	203643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488247
4099	NC_002679	GTC	2	6	203673	203678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488247
4100	NC_002679	CGA	2	6	203688	203693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488247
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4102	NC_002679	CAA	2	6	203757	203762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488247
4103	NC_002679	GC	3	6	203826	203831	0 %	0 %	50 %	50 %	13488247
4104	NC_002679	GCG	2	6	203846	203851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488247
4105	NC_002679	CCCG	2	8	203876	203883	0 %	0 %	25 %	75 %	13488247
4106	NC_002679	ATT	2	6	203893	203898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488247
4107	NC_002679	C	7	7	203936	203942	0 %	0 %	0 %	100 %	13488247
4108	NC_002679	ATC	2	6	203965	203970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488247
4109	NC_002679	CGC	2	6	204187	204192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488248
4110	NC_002679	GCG	2	6	204360	204365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488248
4111	NC_002679	GAT	2	6	204421	204426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488248
4112	NC_002679	AGC	2	6	204432	204437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488248
4113	NC_002679	CAT	2	6	204466	204471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488248
4114	NC_002679	AGC	2	6	204491	204496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488248
4115	NC_002679	GGA	2	6	204607	204612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488248
4116	NC_002679	GGC	2	6	204619	204624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488248
4117	NC_002679	GGCG	2	8	204642	204649	0 %	0 %	75 %	25 %	13488248
4118	NC_002679	GCGTG	2	10	204685	204694	0 %	20 %	60 %	20 %	13488248
4119	NC_002679	G	6	6	204782	204787	0 %	0 %	100 %	0 %	13488248
4120	NC_002679	CGG	2	6	204802	204807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488248
4121	NC_002679	CTA	2	6	204817	204822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488248
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4123	NC_002679	CTT	2	6	204951	204956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488248
4124	NC_002679	GC	3	6	204991	204996	0 %	0 %	50 %	50 %	13488248
4125	NC_002679	ACC	2	6	205055	205060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488248
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4243	NC_002679	ATGCA	2	10	211149	211158	40 %	20 %	20 %	20 %	13488127
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4249	NC_002679	TAA	2	6	211463	211468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488127
4250	NC_002679	TTGC	2	8	211534	211541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4251	NC_002679	AT	3	6	211569	211574	50 %	50 %	0 %	0 %	13488128
4252	NC_002679	GCC	2	6	211639	211644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488128
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4261	NC_002679	GCT	2	6	211991	211996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488128
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4272	NC_002679	TTG	2	6	212783	212788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_002679	CG	3	6	212828	212833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4274	NC_002679	C	6	6	212893	212898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4275	NC_002679	GT	3	6	212957	212962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4276	NC_002679	ATCG	2	8	213009	213016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4277	NC_002679	CGAAC	2	10	213056	213065	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4278	NC_002679	GCCAC	2	10	213067	213076	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4279	NC_002679	GC	3	6	213095	213100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4280	NC_002679	AGC	2	6	213157	213162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488129
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4283	NC_002679	CGCC	2	8	213215	213222	0 %	0 %	25 %	75 %	13488129
4284	NC_002679	GCT	2	6	213227	213232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488129
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4358	NC_002679	GC	4	8	217277	217284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4359	NC_002679	CCAG	2	8	217353	217360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4360	NC_002679	GGC	2	6	217446	217451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488357
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4365	NC_002679	GA	3	6	217814	217819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4366	NC_002679	GTCG	2	8	217864	217871	0 %	25 %	50 %	25 %	13488251
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4371	NC_002679	GCAT	2	8	218055	218062	25 %	25 %	25 %	25 %	13488251
4372	NC_002679	TCCAC	2	10	218079	218088	20 %	20 %	0 %	60 %	13488251
4373	NC_002679	GCC	2	6	218223	218228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488251
4374	NC_002679	ACG	2	6	218266	218271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488251
4375	NC_002679	CGT	2	6	218319	218324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488251
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4378	NC_002679	CATGG	2	10	218454	218463	20 %	20 %	40 %	20 %	13488251
4379	NC_002679	TCG	2	6	218528	218533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488251
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4394	NC_002679	GCG	2	6	219360	219365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4396	NC_002679	GTC	2	6	219462	219467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4398	NC_002679	TC	4	8	219494	219501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4401	NC_002679	GAG	2	6	219669	219674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4402	NC_002679	AT	3	6	219676	219681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_002679	GCCG	2	8	219705	219712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4404	NC_002679	GCA	2	6	219728	219733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4406	NC_002679	CGT	2	6	219763	219768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4408	NC_002679	TTC	2	6	219854	219859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4409	NC_002679	CCT	2	6	219873	219878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488131
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4486	NC_002679	ATAGA	2	10	223502	223511	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4488	NC_002679	TCT	2	6	223557	223562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4489	NC_002679	CTT	2	6	223619	223624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488133
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4495	NC_002679	TTCCC	2	10	223864	223873	0 %	40 %	0 %	60 %	13488133
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4497	NC_002679	TCT	2	6	224001	224006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488133
4498	NC_002679	TCGG	2	8	224047	224054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4499	NC_002679	TCC	2	6	224143	224148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4500	NC_002679	CT	3	6	224156	224161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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